Bilgisayarın her açılışta check disk yapma sorunu

Merhabalar,

Firmamızda 3 gündür çoğu kullanıcıdan her açılışta check disk yapma sorunu konusunda şikayet almaktayım.

Check disk sorununu  

chkntfs /x c:    --- > komutu ile giderebilmekteyim ama bunun geçici bir çözüm olduğu kanısındayım.

fsutil dirty query c: komutunu girdiğimde ise diskin kirli olduğunu söylemekte.akabinde ,

chkdsk /f /r c: komutunu girip  bir sonraki açılışta check disk yapmasını planlıyorum.Ancak sonraki açılıştaki check disk işlemi 5-6 saati buluyor.Bu işlemi her bilgisayar için yaptığımı düşünürsek baya bir uzun sürecek gibi.Ayrıca bir anda ve birçok bilgisayarda aynı sorunun çıkması bilgisayarlarda virüs olduğu düşüncesini aklıma getiriyor.Elimdeki antivirüs programı ise virüs bulamıyor.Ne yapmam gerekir yardımcı olur musunuz ?